大豆
非转基因大豆：为椭圆形状，有点扁。肚脐为浅褐色。豆大小不一。打出来的豆浆为乳白色
转基因大豆：为圆形，滚圆。肚脐为黄色或黄褐色。豆大小差不多。打出来的豆浆有点黄，用此豆制作的豆腐什么的都有点黄色。

胡萝卜
非转基因胡萝卜：表面凸凹不平，一般不太直，从头部到尾部是从粗到细的。且头部是往外凸出来的。
转基因胡萝卜：表面相对较光滑，一般是直的，它的尾部有时比中间还粗。且头部是往内凹的。

土豆
非转基因土豆：样子比较难看，一般颜色比较深，表面坑坑洼洼的，同时表皮颜色不规则，削皮之后，其表面很快会颜色变深，皮内为白色。
转基因土豆：表面光滑，坑坑洼洼很浅，颜色比较淡。削皮之后，其表面无明显变化。

玉米
转基因玉米：甜脆、饱满、体形优美、头颗粒尾差不多

大米
在中国取得转基因大米合法种植权的地区是湖北，要警惕细长的很亮的米。容易与东北“长粒香”混淆，买的时候一定要看清原产地。

西红柿
转基因西红柿：颜色鲜红很好看，果实较硬，不易裂果。
非转基因西红柿：成熟以后，捏起来里面是软的，不耐储存，味酸。

木瓜
据悉，市场上卖的95%以上的木瓜都是，这或许出乎很多人的想象。

其他鉴别方法
（1）超市购买食品时一定要上心，先查是否有转基因标注。根据《农业转基因生物标识管理办法》，转基因食品应有标注。但这些标注怕见人，小到只有1.8毫米高，而且躲在最不显眼处，仔细查总是可以查到的。
（2）超市西红柿、木瓜大部份是转基因，坚决不买。从安全和质量上说，个体农贩水果类食品要比超市好得多。特别不要迷信外资超市，那里的东西好看而不好吃，坏的、假的太多。
（3）玉米使用转基因最早、最广、最多，购买任何玉米食品均要慎之又慎，哪怕超市卖的玉米窝窝头。
（4）转基因小麦籽粒色白透明发亮，全角质，属硬质强筋优质面包小麦品种，特优转基因9506小麦2008年在安徽面世，面粉中还有漂白剂、滑石粉混在里面，就更难识别。
（5）转基因水稻中国偷偷搞了好几年，少数流入市场，特别要警惕又长又瘦又亮的大米。东北大米目前无转基因，暂可放心，一定要看外包装袋，如黑龙江、吉林和辽宁的米业，东北米是粳米，短圆粒型、这与湖北、湖南一带种植的转基因水稻中长粒型有本质的区别、容易识别。另外，泰国禁止转基因，其米无问题。
（6）小米、燕麦、荞麦、高梁均属小宗粮食作物，还来不及去转基因。花生是我国独特产品，暂无转基因，红薯也未转基因
（7）进口水果的标签。一般来说，在标签的最下方一般印有出口国的名称，中间的英文字母标明水果的名称，最上方的英文字母标识的是出口企业的名称。在每个标签的中间一般有4位阿拉伯数字：3字开头的表示是喷过农药。4字开头的表示是转基因水果；5字开头的表示是杂交水果。